​Haanja kõrgustikust on tänapäeval ligikaudu pool metsa all. Siin leidub peaaegu kõiki Eestis esinevaid metsatüüpe, v.a. loometsad. Vanemates puistutes on ülekaalus kuusk, mis siinmail on reeglina kõrgekasvuline. Siinsed mullad on enamasti haritud põllumaaks. Lõuna-Eesti muldadele iseloomulik salumets on praeguseks säilinud vaid jõeorgudes või küngaste väga järskudel nõlvadel.